臺媒稱，臺菲關系緊張，網(wǎng)絡黑客戰(zhàn)先一步上場，“立委”也要求臺軍強化網(wǎng)絡攻擊能力。對此，臺行政主管部門政務委員張善政指出，臺灣可能有這樣的能量，但全世界都是可做不可說。臺軍通信參謀次長室次長胡延年表示，臺軍網(wǎng)絡中隊將在7月1日正式編組，但在非戰(zhàn)爭狀態(tài)下，不會發(fā)動攻擊。
據(jù)臺灣《工商時報》5月16日報道，臺“立委”主動要求臺當局應成立網(wǎng)軍，以求在必要時主動發(fā)動攻擊。對此，張善政出席國民黨“立院黨團”記者會時指出，網(wǎng)軍在全世界都是可做不可說，臺灣過去可能也有培養(yǎng)網(wǎng)軍的能量，但是備而不用，未來則可協(xié)助臺當局行政部門做防備工作。張善政表示，根據(jù)臺當局統(tǒng)計，在臺菲網(wǎng)絡戰(zhàn)開打后，已經(jīng)接獲10筆臺當局網(wǎng)站遭黑的通報，頻率確實比往常高。他說，臺當局網(wǎng)站近來主要受到來自菲律賓的攻擊，一開始攻擊來自菲律賓，但后來則通過菲律賓鄰國進行跳板攻擊，但都被臺方擋下，目前臺當局也已經(jīng)從源頭做流量管制，為了避免遭到攻擊，臺當局已經(jīng)逐漸全面封鎖菲律賓IP流量。不過民間還是有40個網(wǎng)站被置換頁面。此外，臺北市、新北市、桃園縣和臺南市地方政府網(wǎng)站也遭受攻擊，其他縣市的情況就更辛苦，形成防黑客的漏洞。
張善政說，馬英九高度重視臺當局資訊安全工作，臺當局各部會都動用預備金強化相關功能，未來也會編列充足預算。至于在這波網(wǎng)絡攻擊中受損較慘重的臺地方政府，未來也需要補強。張善政表示，過去大家很少聽到菲律賓有網(wǎng)軍，但其實菲律賓民間業(yè)者的技術能量應該還不錯，只是過去并未必與政府有關聯(lián)性，官方涉入的機會可能并不高。目前臺當局已經(jīng)通過民間網(wǎng)絡組織向菲律賓要求管制網(wǎng)絡攻擊，否則不排除全面封鎖菲律賓IP。臺軍通信參謀次長室次長胡延年則表示，臺軍的網(wǎng)絡中隊，一直都在積極準備，但在不是戰(zhàn)爭或是準戰(zhàn)爭行為下，網(wǎng)絡中隊不能變成發(fā)動攻擊的黑帽戰(zhàn)士。
《臺灣蘋果日報》5月16日報道稱，臺菲漁業(yè)沖突無意間開辟了另一個隱形戰(zhàn)場：網(wǎng)絡戰(zhàn)爭。臺灣及菲律賓的黑客、網(wǎng)軍互相黑入對方的高級行政機關，包括軍方，擾亂對方的資訊，并竊取情報。雖然看不見硝煙，也沒有槍林彈雨，可是其兇險不下于電磁彈，足以在真實開戰(zhàn)時癱瘓對方的指管通情體系。這是不對稱作戰(zhàn)的具體實現(xiàn)，也是臺灣淡江大學國際事務與戰(zhàn)略研究所研究員林中斌教授所說的“點穴戰(zhàn)”。
報道稱，菲律賓態(tài)度強硬，菲律賓官網(wǎng)持續(xù)成為兩岸黑客聯(lián)手攻擊目標，這波網(wǎng)絡黑客制裁力道逐漸加強，相較于菲律賓黑客能力，臺灣黑客明顯占上風，網(wǎng)友流傳菲一名黑客，15日凌晨3時發(fā)出求饒信指出：“希望兩國的黑客能停火，讓政府來解決此事！”臺灣網(wǎng)軍則回應：“不公開在國際道歉，絕不會罷手！”
臺灣資訊安全防護廠商中華龍網(wǎng)公司透露，臺灣高手級的黑客，這兩天異常的低調，“研判他們恐在趕寫木馬程序，一旦出招，恐讓菲律賓災情慘重。”臺灣黑客群起應戰(zhàn)，日前一度造成菲律賓2/3的官網(wǎng)癱瘓，菲政府緊急派員修復，但昨仍有1/3處于半癱瘓狀態(tài)，逼得菲律賓官方找云端業(yè)者，將主機放上去避免再受攻擊。
不久之前，臺灣安全主管部門才在立法機構報告平均每年網(wǎng)站遭黑客攻擊的情況，但這些報告內容對民眾而言，都不及這次臺菲網(wǎng)戰(zhàn)那么有參與感，因為每個人都可以加入這場戰(zhàn)爭。現(xiàn)在戰(zhàn)爭的形式因科技日新月異，而呈現(xiàn)不同狀態(tài)，但網(wǎng)絡絕對是21世紀不能忽略的重要武器。臺灣不一定就是攻擊的一方，但是備而不用，蓄積能量，也是實力的一部分。臺灣網(wǎng)軍可借這次菲律賓的蠻橫，演練入侵他國網(wǎng)路的能力，準備好將來在真實的不對稱戰(zhàn)爭中，網(wǎng)路攻擊與防衛(wèi)的技術與知識。