記者從華中農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉,經(jīng)過園藝學(xué)、基因組學(xué)、生物信息學(xué)等科研人員一年多的努力,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)完成了甜橙基因組拼接與注釋,獲得了較高質(zhì)量的甜橙基因組。這標(biāo)志著我國在果樹作物基礎(chǔ)研究方面已達(dá)到國際領(lǐng)先水平。
華中農(nóng)業(yè)大學(xué)鄧秀新院士領(lǐng)銜的柑橘研究團(tuán)隊(duì)長期堅(jiān)持柑橘種質(zhì)資源與遺傳改良研究。2010年,該團(tuán)隊(duì)通過花粉誘導(dǎo)培養(yǎng)獲得了甜橙雙單倍體純系材料。該純系材料是基因組測序的理想材料,也是華中農(nóng)大完成此次甜橙基因組序列圖譜繪制的關(guān)鍵和基礎(chǔ)。
已完成的基因組序列圖譜顯示,甜橙有9對(duì)染色體,基因組大小為367M。基因組注釋結(jié)合了豐富的基因表達(dá)數(shù)據(jù),包括愈傷組織、葉、花和果實(shí)等組織的轉(zhuǎn)錄組。通過遺傳標(biāo)記和染色體原位雜交分析,華中農(nóng)大團(tuán)隊(duì)將甜橙基因組序列整合到9條染色體。通過比較發(fā)現(xiàn),甜橙和葡萄、草莓的共有基因分別為81%和83%。華中農(nóng)大團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn),甜橙基因組中有51%的基因位點(diǎn)處于雜合狀態(tài)。(中新網(wǎng))